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pytorch鎖死在dataloader(訓練時卡死)

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1.問題描述

2.解決方案

(1)Dataloader里面不用cv2.imread進行讀取圖片,用cv2.imread還會帶來一系列的不方便,比如不能結合torchvision進行數據增強,所以最好用PIL 里面的Image.open來讀圖片。(并不適用本例)

(2)將DataLoader 里面的參變量num_workers設置為0,但會導致數據的讀取很慢,拖慢整個模型的訓練。(并不適用本例)

(3)如果用了cv2.imread,不想改代碼的,那就加兩條語句,來關閉Opencv的多線程:cv2.setNumThreads(0)和cv2.ocl.setUseOpenCL(False)。加了這兩條語句之后,并不影響模型的訓練。(并不適用本例)

(4)這種情況應該是屬于pytorch多線程鎖死,在github上看到有該問題,但是沒有解決的。

參考建議

首先確保num_works數量低于CPU數量(如果使用Kubernetes,則設置為pod),但是設置得足夠高,使數據隨時可以用于下一次迭代。

如果GPU在t秒內運行每個迭代,而每個dataloader worker加載/處理單個批處理需要N*t秒,那么您應該將num_workers設置為至少N,以避免GPU停滯。當然,系統中至少要有N個cpu。

不幸的是,如果Dataloader使用任何使用K個線程的庫,那么生成的進程數量就會變成num_workersK = NK。這可能比計算機中的cpu數量大得多。這會使pod節流,而Dataloader會變得非常慢。這可能導致Dataloader不返回批處理每t秒,導致GPU暫停。

避免K個線程的一種方法是通過OMP_NUM_THREADS=1 MKL_NUM_THREADS=1 python train.py調用主腳本。這就限制了每個Dataloader工作程序只能使用一個線程,從而避免了使機器不堪重負。你仍然需要有足夠的num_workers來滿足GPU的需要。

您還應該在_get_item__中優化您的代碼,以便每個worker在較短的時間內完成其批處理。請確保worker完成批處理的時間不受從磁盤讀取訓練數據的時間(特別是當您從網絡存儲中讀取數據時)或網絡帶寬(當您從網絡磁盤讀取數據時)的影響。如果您的數據集很小,并且您有足夠的RAM,那么可以考慮將數據集移動到RAM(或/tmpfs)中,并從那里讀取數據以進行快速訪問。對于Kubernetes,您可以創建一個RAM磁盤(在Kubernetes中搜索emptyDir)。

如果你已經優化了你的_get_item__代碼,并確保磁盤訪問/網絡訪問不是罪魁禍首,但仍然會出現問題,你將需要請求更多的cpu(為了一個Kubernetes pod),或者將你的GPU移動到擁有更多cpu的機器上。

另一個選項是減少batch_size,這樣每個worker要做的工作就會減少,并且可以更快地完成預處理。后一種選擇在某些情況下是不可取的,因為會有空閑的GPU內存不被利用。

你也可以考慮離線做一些預處理,減輕每個worker的負擔。例如,如果每個worker正在讀取一個wav文件并計算音頻文件的譜圖,那么可以考慮離線預先計算譜圖,只從工作者的磁盤中讀取計算的譜圖。這將減少每個worker的工作量。

你也可以考慮將dataloader里的設置pin_memory=False。

補充:pytorch加載訓練數據集dataloader操作耗費時間太久,該如何解決?

筆者在使用pytorch加載訓練數據進行模型訓練的時候,發現數據加載需要耗費太多時間,該如何縮短數據加載的時間消耗呢?經過查詢相關文檔,

總結實際操作過程如下:

1、盡量將jpg等格式的文件保存為bmp文件,可以降低解碼時間;

2、dataloader函數中增加num_workers參數,該參數表示加載數據的線程數,建議設置為該系統中的CPU核心數,若CPU很強勁,而且內存很大,也可以考慮將該數值設置的更大一些。

train_loader=torch.utils.data.DataLoader(dataset=train_dataset,batch_size=batch_size,shuffle=True)

修改為:

train_loader=torch.utils.data.DataLoader(dataset=train_dataset,batch_size=batch_size,shuffle=True,num_workers=multiprocessing.cpu_count())

雖然使用dataloader達到了iter(Dataset)的讀取并行,但是沒有實現在GPU運算時異步讀取數據,可以考慮使用non_blocking實現。

dataloader = data.Dataloader(dataset, batch_size = batch_size, num_workers = workers)
for epoch in range(epochs):
    for batch_idx, (images, labels) in enumerate(dataloader):
        images = images.to(device)
        labels = labels.to(device)

改為:

dataloader = data.Dataloader(dataset, batch_size = batch_size, num_workers = workers, pin_memory = True)
for epoch in range(epochs):
    for batch_idx, (images, labels) in enumerate(dataloader):
        images = images.to(device, non_blocking=True)
        labels = labels.to(device, non_blocking=True)

需要注意的是:只有pin_memory=True并且num_workers>0時non_blocking才會有效。

以上為個人經驗,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支持腳本之家。

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