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Pytorch 如何加速Dataloader提升數(shù)據(jù)讀取速度

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在利用DL解決圖像問(wèn)題時(shí),影響訓(xùn)練效率最大的有時(shí)候是GPU,有時(shí)候也可能是CPU和你的磁盤(pán)。

很多設(shè)計(jì)不當(dāng)?shù)娜蝿?wù),在訓(xùn)練神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的時(shí)候,大部分時(shí)間都是在從磁盤(pán)中讀取數(shù)據(jù),而不是做 Backpropagation 。

這種癥狀的體現(xiàn)是使用 Nividia-smi 查看 GPU 使用率時(shí),Memory-Usage 占用率很高,但是 GPU-Util 時(shí)常為 0% ,如下圖所示:

如何解決這種問(wèn)題呢?

在 Nvidia 提出的分布式框架 Apex 里面,我們?cè)谠创a里面找到了一個(gè)簡(jiǎn)單的解決方案:

https://github.com/NVIDIA/apex/blob/f5cd5ae937f168c763985f627bbf850648ea5f3f/examples/imagenet/main_amp.py#L256 ​

class data_prefetcher():
    def __init__(self, loader):
        self.loader = iter(loader)
        self.stream = torch.cuda.Stream()
        self.mean = torch.tensor([0.485 * 255, 0.456 * 255, 0.406 * 255]).cuda().view(1,3,1,1)
        self.std = torch.tensor([0.229 * 255, 0.224 * 255, 0.225 * 255]).cuda().view(1,3,1,1)
        # With Amp, it isn't necessary to manually convert data to half.
        # if args.fp16:
        #     self.mean = self.mean.half()
        #     self.std = self.std.half()
        self.preload()

    def preload(self):
        try:
            self.next_input, self.next_target = next(self.loader)
        except StopIteration:
            self.next_input = None
            self.next_target = None
            return
        with torch.cuda.stream(self.stream):
            self.next_input = self.next_input.cuda(non_blocking=True)
            self.next_target = self.next_target.cuda(non_blocking=True)
            # With Amp, it isn't necessary to manually convert data to half.
            # if args.fp16:
            #     self.next_input = self.next_input.half()
            # else:
            self.next_input = self.next_input.float()
            self.next_input = self.next_input.sub_(self.mean).div_(self.std)

我們能看到 Nvidia 是在讀取每次數(shù)據(jù)返回給網(wǎng)絡(luò)的時(shí)候,預(yù)讀取下一次迭代需要的數(shù)據(jù),

那么對(duì)我們自己的訓(xùn)練代碼只需要做下面的改造:

training_data_loader = DataLoader(
    dataset=train_dataset,
    num_workers=opts.threads,
    batch_size=opts.batchSize,
    pin_memory=True,
    shuffle=True,
)
for iteration, batch in enumerate(training_data_loader, 1):
    # 訓(xùn)練代碼

#-------------升級(jí)后---------

data, label = prefetcher.next()
iteration = 0
while data is not None:
    iteration += 1
    # 訓(xùn)練代碼
    data, label = prefetcher.next()

這樣子我們的 Dataloader 就像打了雞血一樣提高了效率很多,如下圖:

當(dāng)然,最好的解決方案還是從硬件上,把讀取速度慢的機(jī)械硬盤(pán)換成 NVME 固態(tài)吧~

補(bǔ)充:Pytorch設(shè)置多線程進(jìn)行dataloader時(shí)影響GPU運(yùn)行

使用PyTorch設(shè)置多線程(threads)進(jìn)行數(shù)據(jù)讀取時(shí),其實(shí)是假的多線程,他是開(kāi)了N個(gè)子進(jìn)程(PID是連續(xù)的)進(jìn)行模擬多線程工作。

以載入cocodataset為例

DataLoader

dataloader = torch.utils.data.DataLoader(COCODataset(config["train_path"],
                                                     (config["img_w"], config["img_h"]),
                                                     is_training=True),
                                         batch_size=config["batch_size"],
                                         shuffle=True, num_workers=32, pin_memory=True)

numworkers就是指定多少線程的參數(shù),原為32。

檢查GPU是否運(yùn)行該程序

查看運(yùn)行在gpu上的所有程序:

fuser -v /dev/nvidia*

如果沒(méi)有返回,則該程序并沒(méi)有在GPU上運(yùn)行

指定GPU運(yùn)行

將num_workers改成0即可

以上為個(gè)人經(jīng)驗(yàn),希望能給大家一個(gè)參考,也希望大家多多支持腳本之家。

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